Отдел осуществляет государственный ветеринарный надзор за:
- обеспечением безопасности в ветеринарном отношении пищевых продуктов и пищевого сырья животного происхождения, технического сырья животного происхождения, кормов и кормовых добавок для животных на всех этапах их производства и обращения;
- выполнением мероприятий по предупреждению и ликвидации карантинных и особо опасных болезней животных, реализацией федеральных целевых программ, направленных на предупреждение и ликвидацию болезней животных;
- выполнением мероприятий по защите населения от болезней, общих для животных и людей;
- выполнением мероприятий по охране территории Российской Федерации от заноса заразных болезней животных из иностранных государств;
- безопасностью в ветеринарно-санитарном отношении поднадзорной продукции, поступающей по импорту и экспорту;
- соблюдением требований ветеринарного законодательства Российской Федерации и международных договоров с участием Российской Федерации на государственной границе Российской Федерации (включая пункты пропуска через государственную границу) и на транспорте;
- лицензирование деятельности по изготовлению и реализации ветеринарных препаратов;
-осуществление контроля за полнотой и качеством осуществления органами государственной власти субъектов Российской Федерации переданных им полномочий Российской Федерации в области ветеринарии.