В сфере карантина растений отдел осуществляет следующие полномочия:
- мероприятия по охране территории Российской Федерации от заноса, распространения карантинных вредителей растений, болезней растений и растений-сорняков из-за пределов РФ;
- контроль за проведением мероприятий по локализации и ликвидации выявленных на территории области карантинных объектов;
- мероприятия ограничительного и профилактического характера, направленные на обеспечение фитосанитарного благополучия территории Белгородской области и РФ;
- проведение досмотра подкарантинной продукции на ППКР и СВХ, согласно Номенклатуры, поступившей из-за пределов РФ;
- проведение карантинного досмотра подкарантинной продукции, отгружаемой на экспорт, поступающей в область из других регионов РФ и отправляемой за пределы области в другие регионы России;
- осуществление карантинной фитосанитарной сертификации подкарантинной продукции (подкарантинного материала, подкарантинного груза);
- контрольно-надзорные мероприятия за исполнением юридическими и физическим лицами законодательства Российской Федерации и Белгородской области в области карантина растений, при производстве, хранении, реализации, переработке и транспортировке подкарантинной продукции;
- контрольно-надзорные мероприятия за проведением фитосанитарного обеззараживания подкарантинных объектов (земли любого целевого назначения, здания, сооружения, резервуары, места складирования, оборудование, транспортные средства, контейнеры, подкарантинная продукция и иные объекты), которые могут являться источниками проникновения на территорию Российской Федерации и (или) распространения на ней карантинных объектов;
- проведение контрольных обследований посевов, произведенных импортными и отечественными семенами и посадочным материалом, и других сельскохозяйственных угодий, в том числе совместно с другими специализированными отделами Управления, а также мест для хранения и переработки продукции растительного происхождения, с целью своевременного выявления карантинных вредителей, болезней растений и растений - сорняков и принятие мер по их локализации и ликвидации;
- проведение контрольных обследований посевов и насаждений на сортоучастках, в питомниках, научно-исследовательских учреждениях, семеноводческих и цветочно-декоративных хозяйствах в целях получения семенного и посадочного материала свободного от карантинных вредителей, болезней растений и сорняков;
- принимает в пределах своей компетенции решения о введении карантинных фитосанитарных режимов, их изменению, отмене, устанавливает и упраздняет карантинные фитосанитарные зоны;
- иные полномочия в установленной сфере деятельности, если такие полномочия предусмотрены федеральными законами, нормативными правовыми актами Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации, нормативными правовыми актами Министерства сельского хозяйства Российской Федерации, актами Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору, приказами и распоряжениями Управления.